このエラーメッセージ「slurmstepd: error: 1つのOOMキルイベントがstep 3475229.batch cgroupで検出されました」は、Slurmのログに表示されるものです。これは、ジョブがOOMキルイベントによって終了されたことを示しています。
このエラーの原因を分析するために、以下のステップを実行できます。
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メモリ制限: ジョブが要求するメモリ量が実際の物理メモリ量を超えていないか確認します。ジョブのメモリ制限が適切に設定されているか確認しましょう。
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スワップ領域: ジョブがスワップ領域を使用している場合、スワップが十分に設定されているか確認します。スワップ領域が不足している場合、メモリ不足の問題が発生する可能性があります。
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ジョブのリソース使用状況の監視: ジョブの実行中にリソース使用状況を監視し、メモリ使用量が急増しているプロセスやリークが発生しているプロセスを特定します。過剰なメモリ使用を引き起こす可能性のあるコードのセクションを特定します。
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ステップの再試行: ジョブがOOMキルによって終了された場合、ジョブを再試行する前に、メモリ制限やスワップ領域の設定など、適切な変更を行います。
以下は、Slurmの設定ファイルの一部の例です。
# slurm.conf
# メモリの制限
MemoryLimit=10G
# スワップ領域
SwapSpace=2Gこれは一般的な設定の例であり、環境によって異なる場合があります。適切な設定は、クラスターのリソースと要件に基づいて調整する必要があります。